ABCF1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-405684

Übersicht

ABCF1 (ATP-binding cassette sub-family F member 1) ist ein essentielles zytosolisches ABC-Protein ohne Transmembrandomänen und wirkt hauptsächlich bei der Translationsinitiation sowie in ribosomenassoziierten Prozessen. Es interagiert mit Komponenten der eIF2/eIF2B-Achse und weiteren Initiationsfaktoren und verknüpft damit eine ATP-abhängige Regulation mit der Kontrolle der Proteinsynthese während zellulären Stresses und der angeborenen Immun-Signalgebung. ABCF1 wurde zudem mit NF-κB-assoziierten Entzündungswegen und nukleinsäuregetriggerten Antworten in Verbindung gebracht und verbindet so die Translationsregulation mit antiviralen Programmen und Zytokinantworten. Eine fehlregulierte ABCF1-Expression oder -Aktivität wurde in Krebs- und Entzündungskrankheitsmodellen mit veränderter Proliferation und Immunphänotypen assoziiert, was seinen Einsatz in mechanistischen Studien zur Stressadaptation und Wirtsabwehr unterstützt.

Das ABCF1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des ABCF1-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des ABCF1-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von ABCF1 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die ABCF1-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von ABCF1-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der ABCF1-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf ABCF1-Exone abzielen, die für die ABCF1-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere ABCF1-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom ABCF1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom ABCF1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des ABCF1-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das ABCF1 HDR-Plasmid (h) und ABCF1 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von ABCF1-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten ABCF1-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.