USP41 的化学抑制剂采用多种机制影响其在细胞过程中的功能。Trichostatin A 是一种已知的组蛋白去乙酰化酶抑制剂,它能增加组蛋白的乙酰化,从而导致染色质结构的改变。这些改变会对 DNA 的可及性产生下游影响,从而改变 USP41 与染色质或其底物蛋白的相互作用,抑制 USP41 的活性。氯喹会增加溶酶体的 pH 值,干扰自噬等降解途径。对这些途径的干扰会影响 USP41 的周转或循环,最终导致其功能受到抑制。MG132 和硼替佐米是蛋白酶体抑制剂,会导致多泛素化蛋白质的积累。泛素-蛋白酶体系统的这种饱和状态会阻碍 USP41 结合和处理其底物的能力,而这对其去泛素化活性至关重要。
其他化合物,如 Eeyarestatin I,会通过抑制 p97 ATP 酶干扰内质网相关降解途径,导致错误折叠的蛋白质在内质网中积累,从而影响 USP41 的功能。乳胞素和环氧美辛这两种蛋白酶体抑制剂都会导致泛素化蛋白质的积累。这种积累会与 USP41 竞争或使 USP41 饱和,从而降低其功效。氟维司群以雌激素受体为靶标进行蛋白酶体降解,可通过占据蛋白酶体和限制 USP41 访问其底物来间接抑制 USP41。Withaferin A 可与蛋白酶体结合并抑制其活性,从而导致通常需要 USP41 进行去泛素化的蛋白质堆积。金属离子螯合剂 O-菲罗啉虽然不会直接抑制 USP41,但会影响各种依赖金属的酶和细胞途径,从而间接影响 USP41 的活性。最后,MLN4924 和银杏酸分别通过抑制 NEDD8 激活酶和 SUMO 激活酶在上游发挥作用,影响泛素链的周转和 SUMO 化过程,从而影响 USP41 的功能作用。
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