在核小体内,组蛋白 H2B 与组蛋白 H4 配对形成二聚体,两个这样的二聚体与组蛋白 H3-H4 四聚体结合,DNA 盘绕在四聚体周围。H2B.S变体具有独特的结构特征或翻译后修饰,使其有别于其他H2B变体,并在染色质结构和基因组功能中发挥特殊作用。以 H2B.S 为靶标的激活剂会与该变体结合,从而可能影响其与 DNA、组蛋白 H4 和 H3-H4 四聚体以及非组蛋白染色质相关蛋白的相互作用。这种激活的功能性后果可能会导致核小体稳定性和沿 DNA 的间距发生变化,染色质的高阶折叠发生变化,或 DNA 与各种结合蛋白和参与转录、复制和修复等过程的酶的可及性发生改变。
组蛋白 H2B.S 激活剂的发现和特征描述需要采取多步骤方法,将合成化学与各种分析和生物技术相结合。这一过程将从合成或鉴定能够选择性结合 H2B.S 变体的分子开始。利用 AlphaScreen 或荧光共振能量转移(FRET)等技术进行高通量筛选测定,可用于检测和量化组蛋白变体与潜在激活剂之间的相互作用。一旦确定了候选分子,将对它们进行进一步分析,以确定其结合机制。表面等离子体共振(SPR)或等温滴定量热法(ITC)等技术将提供有关 H2B.S 与激活剂之间相互作用的动力学和热力学数据。结构研究,包括 X 射线晶体学、低温电子显微镜或核磁共振光谱学,将详细揭示 H2B.S 上的激活剂结合位点以及诱导的构象变化,提供这些激活剂如何与其目标相互作用的三维视角。在阐明结构的同时,还将进行功能测试,以评估这些激活剂对核小体组装和染色质结构的影响。例如,可以使用含重组 H2B.S 的核小体进行体外重组试验,以了解激活剂如何影响核小体的形成、稳定性以及核小体在 DNA 上的定位。还可以利用更广泛的基因组学技术,如利用测序(ATAC-seq)的转座酶可及染色质测定法,来衡量 H2B.S 激活剂对整个基因组染色质的可及性和组织的影响。通过这些平行的研究途径,可以全面了解 H2B.S 的生物学作用及其靶向激活对染色质动力学的影响。
関連項目
产品名称 | CAS # | 产品编号 | 数量 | 价格 | 应用 | 排名 |
---|---|---|---|---|---|---|
Suberoylanilide Hydroxamic Acid | 149647-78-9 | sc-220139 sc-220139A | 100 mg 500 mg | $130.00 $270.00 | 37 | |
一种 HDAC 抑制剂,可导致组蛋白乙酰化增加,从而可能影响组蛋白基因的表达。 | ||||||
L-Noradrenaline | 51-41-2 | sc-357366 sc-357366A | 1 g 5 g | $320.00 $475.00 | 3 | |
组蛋白去甲基化酶抑制剂,可改变组蛋白甲基化模式,从而可能影响组蛋白的表达。 | ||||||
RG 108 | 48208-26-0 | sc-204235 sc-204235A | 10 mg 50 mg | $128.00 $505.00 | 2 | |
一种 DNA 甲基转移酶抑制剂,可导致 DNA 去甲基化,从而可能影响各种基因的表达。 | ||||||
Mocetinostat | 726169-73-9 | sc-364539 sc-364539B sc-364539A | 5 mg 10 mg 50 mg | $210.00 $242.00 $1434.00 | 2 | |
一种 HDAC 抑制剂,可导致染色质结构发生变化,并可能影响组蛋白基因的表达。 | ||||||
Disulfiram | 97-77-8 | sc-205654 sc-205654A | 50 g 100 g | $52.00 $87.00 | 7 | |
一种乙醛脱氢酶抑制剂,可能会对组蛋白乙酰化和基因表达产生脱靶效应。 | ||||||
Chaetocin | 28097-03-2 | sc-200893 | 200 µg | $120.00 | 5 | |
组蛋白甲基转移酶 SUV39H1 的特异性抑制剂,可能会影响染色质结构和基因表达。 | ||||||
MS-275 | 209783-80-2 | sc-279455 sc-279455A sc-279455B | 1 mg 5 mg 25 mg | $24.00 $88.00 $208.00 | 24 | |
一种 HDAC 抑制剂,可影响染色质乙酰化状态并间接影响基因表达,包括组蛋白。 | ||||||
Anacardic Acid | 16611-84-0 | sc-202463 sc-202463A | 5 mg 25 mg | $100.00 $200.00 | 13 | |
一种可抑制组蛋白乙酰转移酶(HAT)的天然化合物,可能会影响组蛋白的修饰和表达。 | ||||||
Scriptaid | 287383-59-9 | sc-202807 sc-202807A | 1 mg 5 mg | $63.00 $179.00 | 11 | |
HDAC 抑制剂有可能改变染色质乙酰化并影响基因表达,包括组蛋白变体的表达。 |