DUB3 抑制剂是指一类专门用于靶向抑制去泛素化酶(DUB3,也称为 USP17(泛素特异性肽酶 17)或 USP17L2)活性的化合物。泛素化是一种翻译后修饰,泛素蛋白附着在底物蛋白质上,标记其降解或改变其细胞位置或活性。DUB(如 DUB3)通过清除底物上的泛素分子来逆转这一过程,从而调节蛋白稳态和其他细胞信号通路。因此,DUB3 抑制剂会与这种酶的活性位点结合,从而可能影响其催化活性。抑制 DUB3 会影响细胞内泛素化和去泛素化的平衡,从而对细胞功能和信号通路产生各种下游影响。
开发 DUB3 抑制剂首先要了解该酶的结构和功能。X射线晶体学、核磁共振(NMR)和冷冻电镜等结构生物学工具可用于确定DUB3的三维结构。有了这些结构信息,科学家们就能确定对酶的去泛素化活性至关重要的活性位点和潜在的异构位点。然后就可以采用高通量筛选方法,寻找与 DUB3 上这些位点具有结合亲和力的小分子。这些初步发现的化合物将通过各种体外实验进一步验证,这些实验旨在测量化合物对 DUB3 酶活性的抑制作用。例如,使用荧光或电致化学发光的试验可以检测底物蛋白释放泛素的情况,从而显示抑制剂的功效。
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