Datos CRISPR no: la imagen ilustra la calidad de los anticuerpos para visualizar los resultados de los experimentos CRISPR.
Datos CRISPR no: la imagen ilustra la calidad de los anticuerpos para visualizar los resultados de los experimentos CRISPR.
XRN1 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-401910
- Especies Diana: human
- 20 µg de plásmido de ADN purificado listo para la trasfección; suficiente para 20 transfecciones máximo
- XRN1 El plásmido CRISPR/Cas9 Knockout (KO) (h) es un conjunto de plásmidos, cada uno de los cuales codifica la nucleasa Cas9 y un ARN guía (gRNA) de 20 nt específico para el objetivo, diseñado para lograr la máxima eficiencia de knockout utilizando secuencias derivadas de la biblioteca GeCKO v2
- Las secuencias de gRNA dirigen a Cas9 para que induzca roturas de doble cadena (DSB) específicas en el locus genómico XRN1, lo que da lugar a la inactivación del gen mediante unión de extremos no homólogos (NHEJ)
- Los genes de resistencia a la puromicina y RFP están flanqueados por sitios LoxP, lo que permite la eliminación de los marcadores de selección mediante la recombinasa Cre (Vector Cre: sc-418923) tras el establecimiento de líneas celulares knockout estables
- Tras la transfección, la eficacia del knockout puede comprobarse mediante WB, IF ó IHC utilzando el anticuerpo: XRN1 Anticuerpo (C-1): sc-165985
Información sobre pedidos
| Nombre del producto | Número de catálogo | UNIDAD | Precio | CANTIDAD | Favoritos | |
XRN1 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h) | sc-401910 | 20 µg | $397.00 |
Descripción general
XRN1 codifica una exorribonucleasa 5′→3′ altamente conservada que impulsa el recambio citoplasmático del ARNm al degradar transcritos desprovistos de caperuza (decapped) y eliminar intermediarios de la degradación del ARN. Es un componente central de la regulación génica posranscripcional, al vincular la eliminación de la caperuza (decapping) y la degradación exonucleolítica con vías que controlan la vigilancia del ARNm, la dinámica de los gránulos de estrés y la detección por la inmunidad innata de ARNs anómalos o virales. A través de su función en el control de calidad del ARN y la remodelación del transcriptoma, XRN1 influye en las respuestas celulares al estrés y a la infección, así como en programas más amplios de proliferación y diferenciación. La degradación del ARN desregulada y la actividad deteriorada de XRN1 se han asociado con alteraciones en la señalización del interferón, fenotipos del neurodesarrollo y cambios en redes de expresión génica relevantes para el cáncer.
El plásmido CRISPR/Cas9 KO XRN1 (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen XRN1 en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del XRN1 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.
El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de XRN1 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína XRN1.
Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en XRN1 para la investigación de la señalización de XRN1, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.
Características principales
- sgRNA dirigidos a los exones de XRN1 críticos para la función de XRN1
Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de XRN1 para mejorar la eficiencia del knockout
Compatible con la administración mediante transfección
Variantes de diseño
CRISPRs +/- HDRs
- Los gRNA codificados por el plásmido XRN1 CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido XRN1 CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus XRN1. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR XRN1 (h) y el plásmido HDR XRN1 (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología XRN1 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana XRN1 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.