UBXN2B CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-407871

概要

UBXN2B（UBX domain protein 2B）はUBXファミリーのアダプターであり、ポリユビキチン化された基質をAAA+ ATPaseであるp97/VCPに結び付け、基質の引き抜きと、その後のプロテアソームによる分解処理へとつなぐことで、ユビキチン依存的なタンパク質品質管理に関与します。この役割を通じて、UBXN2BはER関連分解（ERAD）の制御、ミスフォールドまたは損傷タンパク質のターンオーバー、ならびに細胞ストレス下におけるプロテオスタシスの維持に寄与します。p97とUBX補因子のネットワークの攪乱は、細胞周期進行、DNA損傷応答、ストレスシグナル伝達など、細胞の生存能や分化プログラムを形作る経路全般と広く関連します。ユビキチン–プロテアソーム系（UPS）の回路における結節点として、UBXN2Bは、プロテオスタシスの不均衡や異常なタンパク質クリアランスが疾患関連表現型に寄与する状況における機構研究の対象として注目されています。

UBXN2B CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるUBXN2B遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、UBXN2B内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、UBXN2Bのオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、UBXN2Bタンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、UBXN2Bシグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、UBXN2B欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• UBXN2Bの機能に不可欠なUBXN2Bエクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、UBXN2Bゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• UBXN2B CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびUBXN2B CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、UBXN2B遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  UBXN2B HDRプラスミド（h）および UBXN2B HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはUBXN2Bホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のUBXN2B標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。