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TRAP150 CRISPR Activation Plasmid (h) | sc-402921-ACT | 20 µg | $397.00 |
Humanes THRAP3 kodiert TRAP150, einen nukleären RNA-bindenden und transkriptionsassoziierten Faktor, der die prä-mRNA-Verarbeitung mit der transkriptionellen Regulation koppelt. TRAP150 ist an spliceosomenassoziierten Komplexen beteiligt und moduliert alternatives Spleißen sowie mRNA-Reifung und unterstützt damit koordinierte Genexpressionsprogramme. Es wurde mit der Kontrolle der DNA-schadensresponsiven Transkription und RNA-Qualitätskontrollprozessen in Verbindung gebracht, einschließlich stressassoziiertem RNA-Metabolismus. Eine Dysregulation von THRAP3/TRAP150-abhängigen Netzwerken der RNA-Prozessierung wurde in krebsrelevanten Kontexten mit veränderter Zellzykluskontrolle und onkogenen transkriptionellen Zuständen in Zusammenhang gebracht.
TRAP150 Das CRISPR-Aktivierungsplasmid (h) bietet einen gezielten, nicht-destruktiven Ansatz zur Hochregulierung der endogenen THRAP3-Expression, ohne die zugrunde liegende DNA-Sequenz zu verändern.
TRAP150 Das CRISPR-Aktivierungsplasmid (h) ist ein aus drei Plasmiden bestehendes synergistisches Aktivierungsmediator-System (SAM), das für eine hocheffiziente, ortsspezifische transkriptionelle Hochregulation des THRAP3-Lokus in menschlichen Zelllinien entwickelt wurde. Das System basiert auf einem katalytisch inaktiven Cas9 (dCas9), das zwei inaktivierende Mutationen (D10A und N863A) trägt, welche die Nukleaseaktivität eliminieren, während die DNA-Bindung erhalten bleibt. Dieses dCas9 ist mit VP64, einem potenten Transkriptionsaktivator, fusioniert und wird zusammen mit einem Blasticidin-Resistenzgen zur Selektion koexprimiert. Das zweite Plasmid kodiert das MS2-p65-HSF1-Fusionsprotein, einen sekundären Aktivatorkomplex, der zusammen mit dCas9-VP64 wirkt, sowie ein Hygromycin-Resistenzgen. Das dritte Plasmid kodiert für eine zielspezifische 20-nt-sgRNA, die an zwei MS2-RNA-Aptamere fusioniert ist, welche den MS2-p65-HSF1-Komplex an die Aktivierungsstelle rekrutieren, begleitet von einem Puromycin-Resistenzgen. Die drei Plasmide werden im Massenverhältnis 1:1:1 verabreicht, um eine ausgewogene Expression aller Systemkomponenten zu gewährleisten.
Nach der Assemblierung am Zielort bindet der SAM-Komplex etwa 200 bp stromaufwärts der THRAP3-Transkriptionsstartstelle, wo VP64, p65 und HSF1 gemeinsam die Transkriptionsmaschinerie rekrutieren und die Hochregulation der endogenen TRAP150-Expression vorantreiben. Im Gegensatz zu nukleaseaktivem Cas9 verursacht dCas9 keine Doppelstrangbrüche und verändert die genomische Sequenz nicht, wodurch der native THRAP3-Locus erhalten bleibt und die Untersuchung von TRAP150-abhängigen Transkriptionsreaktionen am endogenen Locus ermöglicht wird. Dies macht es zu einem wertvollen Werkzeug für Funktionsstudien, die Identifizierung von Zielgenen und die Modellierung der Wiederherstellung des TRAP150-Signalwegs in Tumorzellen mit stillgelegtem oder reduziertem THRAP3-Ausdruck.
Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.