Sam 68 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (m): sc-422795

概要

Khdrbs1はRNA結合タンパク質Sam 68（KHDRBS1）をコードしている。Sam 68はSTARファミリーに属する転写後遺伝子発現の制御因子であり、シグナル伝達をRNA代謝と連結する。Sam 68は特定のRNA配列要素に結合して、選択的スプライシング、mRNAの核外輸送、安定性、翻訳を制御し、ストレス顆粒関連経路を含む動的なリボ核タンパク質複合体にも関与する。Srcファミリーキナーゼやその他のシグナル伝達ノードとのリン酸化依存的相互作用を介して、Sam 68は細胞周期の進行、アポトーシス、分化プログラムに影響を与える。KHDRBS1/Sam 68によるスプライシングおよびRNAプロセシングの破綻は、がん原性シグナル、神経発生に関わる表現型、免疫関連の転写状態と関連づけられており、機構解明研究における広範な有用性を支持している。

Sam 68 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）は、mouse細胞株におけるKhdrbs1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、Khdrbs1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、Khdrbs1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、Sam 68タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、Sam 68シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、Khdrbs1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• Sam 68の機能に不可欠なKhdrbs1エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、Khdrbs1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• Sam 68 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）およびSam 68 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m2）によってコードされるgRNAは、Khdrbs1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  Sam 68 HDRプラスミド（m）および Sam 68 HDRプラスミド（m2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはKhdrbs1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のKhdrbs1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。