PABPC2 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (m): sc-422101

Descripción general

Pabpc2 codifica la proteína citoplasmática de unión a poli(A) 2 (PABPC2), un factor de unión a ARN que se asocia con las colas poli(A) para coordinar la estabilidad del ARNm, la eficiencia de traducción y su recambio mediante interacciones con la maquinaria de iniciación de la traducción y de degradación del ARNm. Como parte de la regulación génica postranscripcional, PABPC2 contribuye al control dinámico de los programas de expresión génica durante las respuestas al estrés celular, la diferenciación y los procesos del desarrollo en el ratón. La alteración de la regulación de las colas poli(A) y la remodelación de los mRNP citoplasmáticos se relacionan ampliamente con una proteostasis desregulada y un metabolismo del ARN aberrante, características comunes en modelos de neurodegeneración, biología del cáncer y señalización inmunitaria. Por lo tanto, Pabpc2 sirve como un nodo útil para investigar vías que acoplan las decisiones sobre el destino del ARNm con el fenotipo celular.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO PABPC2 (m) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen Pabpc2 en líneas celulares mouse. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del Pabpc2 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de Pabpc2 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína PABPC2.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en Pabpc2 para la investigación de la señalización de PABPC2, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de Pabpc2 críticos para la función de PABPC2
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de Pabpc2 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido PABPC2 CRISPR/Cas9 KO (m) y el plásmido PABPC2 CRISPR/Cas9 KO (m2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus Pabpc2. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR PABPC2 (m) y el plásmido HDR PABPC2 (m2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología Pabpc2 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana Pabpc2 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.