HoxD12 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-407472

Descripción general

HOXD12 codifica el factor de transcripción homeobox HoxD12, miembro del clúster HOXD, que contribuye a establecer la identidad posicional durante el desarrollo embrionario y coordina el patrón de formación de las extremidades y del esqueleto axial. Como regulador de unión al ADN, HoxD12 se integra en redes reguladoras HOX más amplias y en el control a nivel de cromatina para moldear programas de transcripción específicos de cada tejido que gobiernan la diferenciación y la morfogénesis. La expresión desregulada de HOXD12 o la alteración de la regulación del clúster HOX se ha asociado con anomalías del desarrollo y se ha descrito en firmas transcripcionales de múltiples tipos de cáncer, lo que refleja su papel en el control de redes génicas relacionadas con el linaje y el crecimiento. En contextos de adultez y enfermedad, una actividad alterada de HOXD12 puede influir en transiciones de estado celular, programas de migración y reactivación de vías del desarrollo.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO HoxD12 (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen HOXD12 en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del HOXD12 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de HOXD12 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína HoxD12.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en HOXD12 para la investigación de la señalización de HoxD12, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de HOXD12 críticos para la función de HoxD12
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de HOXD12 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido HoxD12 CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido HoxD12 CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus HOXD12. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR HoxD12 (h) y el plásmido HDR HoxD12 (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología HOXD12 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana HOXD12 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.