GP-39 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-402147

Descripción general

CHI3L1 codifica GP-39 (YKL-40), una glucoproteína secretada de la familia de las proteínas tipo quitinasa que carece de actividad enzimática, pero modula la organización de la matriz extracelular, la adhesión celular y la remodelación tisular. GP-39 es producida por múltiples tipos celulares, incluidos macrófagos, neutrófilos y células tipo fibroblasto, y se asocia con la señalización inflamatoria y las interacciones entre el estroma y el sistema inmunitario. Está implicada en la regulación de procesos angiogénicos y fibróticos, y se estudia con frecuencia en contextos de inflamación crónica y recambio anómalo de la matriz. La expresión desregulada de CHI3L1 se ha asociado con diversos fenotipos relevantes para la enfermedad, incluidos el estroma asociado al cáncer, la neuroinflamación y estados inflamatorios metabólicos y de las vías respiratorias, lo que la convierte en un nodo útil para la investigación de vías y de mecanismos de biomarcadores.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO GP-39 (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen CHI3L1 en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del CHI3L1 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de CHI3L1 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína GP-39.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en CHI3L1 para la investigación de la señalización de GP-39, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de CHI3L1 críticos para la función de GP-39
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de CHI3L1 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido GP-39 CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido GP-39 CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus CHI3L1. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR GP-39 (h) y el plásmido HDR GP-39 (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología CHI3L1 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana CHI3L1 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.