DDX21 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (bovine): sc-437356

Übersicht

DDX21 kodiert eine nukleoläre DEAD-Box-RNA-Helikase, die mehrere Schritte der Ribosomenbiogenese koordiniert, darunter die Transkription und Prozessierung der prä-rRNA, und die RNA-Polymerase-I-abhängige Funktion des Nukleolus unterstützt. Über ihre RNA-Remodelling-Aktivität trägt DDX21 dazu bei, die rRNA-Reifung mit umfassenderen Programmen des RNA-Stoffwechsels zu verknüpfen, die den Zellzyklusverlauf, die Proteostase und die Reaktionen auf zellulären Stress beeinflussen. Eine Störung der DDX21-Funktion geht mit veränderter nukleolärer Integrität und Translationskapazität einher – Prozesse, die häufig in Zusammenhängen wie proliferativer Signalgebung, Genomstabilität und Stressadaptations-Phänotypen untersucht werden. In bovinen Systemen ist DDX21 relevant für mechanistische Untersuchungen von Wachstum und Entwicklung, Wirt-Pathogen-Interaktionen, die die Ribosomenproduktion beeinflussen, sowie für eine nukleolus-gekoppelte Regulation der Genexpression.

Das DDX21 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (bovine) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des -Gens in bovine-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des -Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die DDX21-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von -defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der DDX21-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf -Exone abzielen, die für die DDX21-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere -Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom DDX21 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (bovine) und vom DDX21 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (bovine2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des -Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das DDX21 HDR-Plasmid (bovine) und DDX21 HDR-Plasmid (bovine2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von -Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten -Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.