cathepsin B Double Nickase Plasmid (h): sc-400360-NIC
- Zielspezies: human
- 20 µg transfektionsfertige, aufgereinigte Plasmid DNA; geeignet für 20 Transfektionen
- Das cathepsin B Double Nickase Plasmid (h) wird als Plasmid-Paar geliefert. Die einzelnen Plasmide kodieren für eine D10A mutierte Cas9 Nuklease sowie für je eine unterschiedliche, zielspezifische 20nt guide RNA (gRNA) Sequenz. Dies erlaubt eine hohe Knockout-Effizienz bei gleichzeitig größerer Spezifität als das entsprechende CRISPR/Cas9 KO Plasmid
- gRNA Sequenzpaare liegen ca. 20 bp auseinander um ein spezifisches Cas9-vermitteltes "Double Nicking" der genomischen DNA zu erlauben und so im Resultat den Effekt eines Doppelstrangbruchs nachzuahmen.
- Ein Plasmid kodiert für ein Puromycin-Resistenzgen zur Selektion von stabilen Knockout-Zellen. Das andere Plasmid kodiert für ein GFP-Gen für den visuellen Nachweis der Transfektion
- cathepsin B Double-Nickase-Plasmid (h) und cathepsin B Double-Nickase-Plasmid (h2) kodieren unterschiedliche gepaarte gRNA-Designs, die auf CTSB abzielen. Möglicherweise ist eines oder sind beide Designs verfügbar
- Nach der Transfektion kann die Effizienz des Gen-Knockouts per Western Blot oder histologisch mit folgendem Antikörper überprüft werden: cathepsin B: sc-365558
Bestellinformation
| Produkt | Katalog # | EINHEIT | Preis | ANZAHL | Favoriten | |
cathepsin B Double Nickase Plasmid (h) | sc-400360-NIC | 20 µg | $410.00 | |||
cathepsin B Double Nickase Plasmid (h2) | sc-400360-NIC-2 | 20 µg | $410.00 |
CTSB kodiert Cathepsin B, eine lysosomale Cysteinprotease, die den intrazellulären Proteinumsatz vorantreibt und zur Antigenprozessierung, zur Autophagie‑Lysosom-Dynamik sowie nach Sekretion oder lysosomalem Austritt zur Umgestaltung der extrazellulären Matrix beiträgt. Die Aktivität von Cathepsin B steht in Wechselwirkung mit dem endo‑lysosomalen Transport, inflammasomassoziierten Antworten und Proteasenetzwerken, die Zellinvasion und Überlebenssignale mitprägen. Eine fehlregulierte CTSB-Expression oder -Aktivität wurde über veränderte Proteostase und proteolytische Signalgebung mit Tumorprogression und Metastasierung, neurodegenerativen Prozessen sowie entzündungsbedingten Gewebeschäden in Verbindung gebracht. Als gut untersuchbarer Knotenpunkt im Proteasesystem wird CTSB aufgrund seiner Rollen in lysosomenabhängigen Zelltodmechanismen und in proteasevermitteltem Remodeling in krankheitsrelevanten Modellen breit erforscht.
cathepsin B Das Double-Nickase-Plasmid (h) besteht aus einem aufeinander abgestimmten Plasmidpaar, das für die hochspezifische Bearbeitung des CTSB-Lokus in human-Zelllinien entwickelt wurde. Jedes Plasmid exprimiert eine Cas9-D10A-Nickase und eine spezifische sgRNA, die auf entgegengesetzte DNA-Stränge innerhalb von CTSB abzielt. Wenn sie auf benachbarte Stellen auf entgegengesetzten DNA-Strängen gerichtet sind, erzeugen die beiden Nickasen versetzte Einzelstrang-Schnitte, die zusammen einen versetzten Doppelstrangbruch erzeugen, was eine koordinierte On-Target-Aktivität beider Guides erfordert. Der resultierende DNA-Bruch wird durch endogene zelluläre Reparaturwege behoben, meist durch nicht-homologe Endverknüpfung (NHEJ), was zu Insertionen oder Deletionen führt, die die CTSB-Funktion stören. Durch die Notwendigkeit einer doppelten sgRNA-Bindung am Zielort erhöht der Doppel-Nick-Ansatz die Spezifität der Bearbeitung und bietet eine komplementäre CRISPR-Strategie für Anwendungen, bei denen eine zusätzliche Kontrolle über die Zielgenauigkeit gewünscht ist.
Um eine effiziente Identifizierung editierter Zellen zu unterstützen, kodiert ein Plasmid GFP zur fluoreszierenden Visualisierung transfizierter Populationen, während das Begleitplasmid ein Puromycin-Resistenzgen für die Antibiotika-Selektion trägt. Zusammen unterstützen diese Merkmale eine effiziente Anreicherung co-transfizierter Populationen und vereinfachen die Validierung von Klonen mit CTSB-Störung.
Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.