Plasmide CRISPR/Cas9 KO C530008M17Rik (m): sc-435830

Présentation

C530008M17Rik code une protéine murine qui reste incomplètement caractérisée, avec peu d’annotations fonctionnelles disponibles dans les ressources génomiques actuelles. En tant que produit génique prédit, elle est souvent étudiée dans le cadre de jeux de données transcriptomiques et protéomiques afin de définir des profils d’expression spécifiques de certains types cellulaires et d’éventuels rôles subcellulaires. Des éléments de preuve émergents issus d’analyses de co‑expression et de cribles de perturbation génétique peuvent aider à situer C530008M17Rik au sein de processus cellulaires plus larges tels que la différenciation, les réponses au stress ou l’homéostasie spécifique d’un tissu, selon le système expérimental. En raison de la rareté des données mécanistiques, des approches de knock‑out ciblé sont couramment utilisées pour clarifier l’implication dans des voies de signalisation et d’éventuels liens avec des phénotypes pertinents pour la biologie du développement et la modélisation des maladies.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO C530008M17Rik (m) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène C530008M17Rik dans les lignées cellulaires mouse. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du C530008M17Rik, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert C530008M17Rik à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine C530008M17Rik.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en C530008M17Rik pour l'étude de la signalisation de C530008M17Rik, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de C530008M17Rik essentiels à la fonction de C530008M17Rik
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de C530008M17Rik pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le C530008M17Rik plasmide CRISPR/Cas9 KO (m) et le C530008M17Rik plasmide CRISPR/Cas9 KO (m2) ciblent des sites distincts au sein du locus C530008M17Rik. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le C530008M17Rik plasmide HDR (m) et le C530008M17Rik (m2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie C530008M17Rik pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles C530008M17Rik définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.