Plasmide CRISPR/Cas9 KO BCDIN3D (h): sc-406497

Présentation

BCDIN3D (BCDIN3D RNA methyltransferase) est une méthyltransférase dépendante de la SAM impliquée dans la modification des extrémités de l’ARN, avec une activité rapportée sur le 5′-monophosphate de certains précurseurs de microARN. En modifiant la maturation des miARN et la stabilité des petits ARN, BCDIN3D peut influencer des programmes de régulation génique post‑transcriptionnelle qui façonnent les transitions d’état cellulaire, la prolifération et les réponses au stress. Des études fonctionnelles ont associé une expression dérégulée de BCDIN3D à des profils de miARN modifiés et à des phénotypes pertinents pour la biologie tumorale, notamment des changements de l’invasion et du potentiel métastatique dans certains contextes cellulaires. En conséquence, BCDIN3D est fréquemment étudiée dans des voies reliant le traitement de l’ARN à la signalisation oncogénique et à un contrôle de l’expression génique de type épigénétique.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO BCDIN3D (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène BCDIN3D dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du BCDIN3D, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert BCDIN3D à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine BCDIN3D.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en BCDIN3D pour l'étude de la signalisation de BCDIN3D, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de BCDIN3D essentiels à la fonction de BCDIN3D
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de BCDIN3D pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le BCDIN3D plasmide CRISPR/Cas9 KO (h) et le BCDIN3D plasmide CRISPR/Cas9 KO (h2) ciblent des sites distincts au sein du locus BCDIN3D. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le BCDIN3D plasmide HDR (h) et le BCDIN3D (h2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie BCDIN3D pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles BCDIN3D définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.