Plasmide CRISPR/Cas9 KO ARMCX1 (h): sc-407214

Présentation

ARMCX1 (armadillo repeat containing, X-linked 1) code une protéine à répétitions armadillo associée aux mitochondries, impliquée dans la coordination de la dynamique mitochondriale, du trafic intracellulaire et du contrôle qualité dans les cellules de mammifères. Par des interactions qui influencent le transport mitochondrial et l’équilibre fusion–fission, ARMCX1 peut moduler la bioénergétique cellulaire, l’homéostasie rédox et la sensibilité à l’apoptose, ce qui l’inscrit dans les programmes de réponse au stress. Dans les neurones et d’autres types cellulaires polarisés, les mécanismes liés à ARMCX1 sont souvent étudiés dans le contexte de la distribution des organites le long des réseaux du cytosquelette et de leurs effets sur la survie cellulaire. Des altérations de l’expression d’ARMCX1 ont été rapportées dans des jeux de données en oncologie et en neurobiologie, ce qui motive des recherches mécanistiques visant à comprendre comment la régulation mitochondriale dépendante d’ARMCX1 contribue à des phénotypes associés aux maladies.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO ARMCX1 (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène ARMCX1 dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du ARMCX1, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert ARMCX1 à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine ARMCX1.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en ARMCX1 pour l'étude de la signalisation de ARMCX1, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de ARMCX1 essentiels à la fonction de ARMCX1
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de ARMCX1 pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le ARMCX1 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h) et le ARMCX1 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h2) ciblent des sites distincts au sein du locus ARMCX1. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le ARMCX1 plasmide HDR (h) et le ARMCX1 (h2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie ARMCX1 pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles ARMCX1 définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.