Os inibidores do ZNF839 englobam um grupo de produtos químicos que têm como alvo várias vias bioquímicas para suprimir indiretamente a atividade funcional do ZNF839. Um desses mecanismos inclui a inibição das proteínas cinases, que são cruciais para os processos de fosforilação dos quais o ZNF839 pode depender para efetuar a ligação ao ADN e a regulação da transcrição. Outro mecanismo envolve a inibição dos proteasomas, que são responsáveis pela degradação das proteínas ubiquitinadas; ao bloquear esta via, a proteólise regulada de que o ZNF839 pode necessitar para o ciclo funcional é interrompida. Além disso, os compostos que inibem a via PI3K/AKT ou a via MAPK/ERK podem ter um efeito a jusante, alterando o ambiente celular e o estado de fosforilação que podem afetar a atividade do ZNF839. Da mesma forma, a inibição da p38 MAPK ou da JNK pode impedir a ativação de factores de transcrição que podem ser necessários para a expressão do ZNF839, levando assim à sua inibição funcional.
Além disso, certos inibidores têm como alvo a síntese de proteínas, o que pode diminuir os níveis de ZNF839 na célula. Por exemplo, a inibição do mTOR pode prejudicar a síntese de proteínas, enquanto outros compostos que interferem com o passo de translocação na síntese de proteínas reduzem diretamente os níveis de ZNF839. As alterações nos padrões de expressão génica são também um alvo, com os inibidores da HDAC a regularem potencialmente a expressão do ZNF839 através da alteração da estrutura da cromatina. Os inibidores da DNA metiltransferase podem induzir a hipometilação do DNA, levando a alterações na expressão genética que podem diminuir a atividade do ZNF839. Além disso, a perturbação da proteostase normal pelos inibidores do proteassoma pode afetar a dobragem e a função do ZNF839. Por último, os inibidores da quinase dependente da ciclina podem impedir a progressão do ciclo celular e a atividade dos factores de transcrição, o que pode resultar numa diminuição da expressão e da atividade do ZNF839.
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