Os inibidores químicos do ZNF790 funcionam através de uma série de interacções bioquímicas que levam à inibição da sua função. A estaurosporina é um potente inibidor da proteína quinase, que pode impedir a atividade dependente da fosforilação do ZNF790, um processo frequentemente essencial para a função da proteína. O LY294002 e a Wortmannin, ambos inibidores da fosfoinositídeo 3-quinases (PI3K), interrompem as vias de sinalização a jusante que são cruciais para a atividade funcional do ZNF790. Ao bloquear a PI3K, estes inibidores impedem a ativação de cinases que o ZNF790 pode necessitar para a sinalização. Além disso, o PD98059 e o U0126 são inibidores selectivos da MEK, que desempenham um papel crucial na via MAPK/ERK. A inibição desta via pode diminuir a fosforilação do ZNF790, conduzindo a uma diminuição da sua atividade.
Além disso, o SB203580 tem como alvo a p38 MAP quinase, que é outra via importante que pode regular a função do ZNF790 através da fosforilação. O SP600125, um inibidor da JNK, pode reduzir a atividade do ZNF790 se a JNK estiver envolvida na sua regulação. O Y-27632, um inibidor da ROCK, interrompe a via da cinase associada à Rho, o que pode influenciar as vias que contribuem para o estado funcional do ZNF790. A PP2, ao inibir as cinases da família Src, poderia diminuir a fosforilação do ZNF790, assumindo que as cinases Src participam na sua ativação ou regulação. A rapamicina, um inibidor da mTOR, pode levar a uma diminuição da atividade das vias que controlam a fosforilação e a regulação do ZNF790. O GF109203X e a queleritrina, ambos inibidores da PKC, podem diminuir o estado de fosforilação e a atividade subsequente do ZNF790 se a PKC estiver envolvida na regulação ou ativação do ZNF790 através da fosforilação.
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