Os inibidores da WDR89 funcionam através de uma variedade de mecanismos para diminuir a atividade desta proteína, que está envolvida em processos celulares como a síntese proteica, o crescimento celular e a sobrevivência. Certos compostos conseguem este objetivo ao visarem a via mTOR, uma via de sinalização crucial para regular a síntese proteica e a proliferação celular. Ao ligarem-se a proteínas que interagem com o mTOR, estes inibidores podem suprimir a atividade da via, levando a uma consequente diminuição da dinâmica funcional do WDR89. Outros inibidores actuam através da obstrução da cascata de sinalização PI3K/AKT, que é essencial para a sobrevivência celular. Ao interromperem a PI3K ou inibirem diretamente a AKT, estes compostos asseguram uma redução a jusante da atividade do WDR89, que está ligada aos resultados desta via.
Além disso, as vias MAPK/ERK e p38 MAPK, que desempenham um papel fundamental na proliferação, diferenciação e resposta ao stress das células, são também alvo de inibidores específicos. Ao inibir seletivamente cinases como a MEK1/2, p38 ou JNK nestas vias, a transdução de sinais críticos é impedida, levando a um declínio subsequente da atividade do WDR89. Alguns compostos exercem os seus efeitos na arquitetura do citoesqueleto, que é fundamental para a forma, a motilidade e o transporte intracelular das células, processos em que o WDR89 pode estar envolvido direta ou indiretamente através da sua associação com outras proteínas. A perturbação da dinâmica do citoesqueleto pode, por conseguinte, prejudicar a localização e a função correctas do WDR89 na célula. Além disso, certos inibidores podem influenciar o sistema ubiquitina-proteassoma, que regula a renovação das proteínas. Ao modularem este sistema, estes inibidores podem afetar a estabilidade e a taxa de degradação do WDR89, levando a uma presença reduzida na célula e a uma consequente diminuição da sua atividade.
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