O WDR89, fazendo parte da intrincada rede de sinalização celular, pode ser ativado por uma variedade de mecanismos que envolvem compostos químicos específicos. Os compostos que elevam os níveis intracelulares de AMPc podem aumentar a atividade de proteínas cinases como a PKA, que é conhecida pela sua capacidade de fosforilar uma vasta gama de substratos. Este evento de fosforilação poderia estender-se ao WDR89, resultando na sua ativação. Do mesmo modo, a utilização de ésteres de forbol específicos que activam a PKC ou de substâncias que aumentam os níveis de cálcio intracelular poderia ativar o WDR89 indiretamente, iniciando uma cascata de eventos que envolvem a calmodulina e as proteínas quinases dependentes de cálcio/calmodulina. Estas cinases têm a capacidade de orientar as proteínas para a fosforilação, o que pode incluir a WDR89, aumentando assim a sua atividade funcional na célula.
Além disso, as moléculas de sinalização que desencadeiam as vias mediadas pelos receptores, como as iniciadas pela ligação da insulina ou de outros factores de crescimento, podem levar à ativação de cinases a jusante, como a Akt. A ativação destas cinases pode resultar na fosforilação do WDR89, aumentando a sua atividade. Além disso, os ionóforos que aumentam os níveis de cálcio intracelular ou os inibidores das proteínas fosfatases podem resultar num aumento líquido do estado de fosforilação das proteínas celulares. Este aumento geral da fosforilação pode afetar o WDR89, conduzindo ao aumento da sua atividade. Os inibidores das proteínas fosfatases inclinam especificamente o equilíbrio para um estado mais fosforilado e ativo na célula, incluindo potencialmente o WDR89.
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