Os inibidores químicos da uroplaquetina IIIb (UPIIIb) funcionam através de diversos mecanismos bioquímicos para perturbar a atividade da proteína. A floretina afecta a UPIIIb ao visar o seu processo de glicosilação, que é fundamental para a dobragem e função adequadas da UPIIIb. Quando a glicosilação é impedida, a UPIIIb não consegue manter a sua estrutura ou o seu papel na membrana celular. Do mesmo modo, a monensina, um ionóforo, perturba os gradientes de iões de sódio, que são essenciais para os processos celulares, incluindo o tráfico e a localização da UPIIIb. Ao alterar as concentrações de iões, a monensina pode impedir os mecanismos de transporte essenciais para a funcionalidade da UPIIIb. A filipina, por outro lado, liga-se ao colesterol da membrana, um componente chave na manutenção das jangadas lipídicas onde a UPIIIb está localizada. Ao interagir com o colesterol, a filipina pode perturbar estes microdomínios e, consequentemente, a atividade da UPIIIb.
Além disso, o ácido ocadaico inibe as proteínas fosfatases, como a PP1 e a PP2A, que são responsáveis pela desfosforilação de proteínas, um passo crítico para a regulação funcional da UPIIIb. A inibição destas enzimas pode, portanto, resultar numa redução da atividade da UPIIIb. A calfostina C e a bisindolilmaleimida I inibem especificamente a proteína quinase C (PKC), essencial para os eventos de fosforilação que regulam as vias de sinalização da UPIIIb. A inibição da PKC por estes compostos leva a uma diminuição da atividade da UPIIIb. Do mesmo modo, o cloridrato de W-7 inibe a calmodulina, que está envolvida nas vias de sinalização do cálcio que regulam a função da UPIIIb. O KT5720, um inibidor da proteína quinase A (PKA), e o Gö 6983, um inibidor pan-PKC, interrompem a fosforilação de proteínas nas vias de sinalização da UPIIIb, prejudicando assim a atividade da UPIIIb. Por último, o PD 98059 e o LY294002 têm como alvo cinases específicas, como a MEK e a PI3K, respetivamente, que são reguladores a montante das vias em que a UPIIIb pode estar envolvida. Ao inibir estas cinases, os compostos podem levar a uma regulação negativa da atividade da UPIIIb na célula.
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