Os activadores do TAF9B são uma classe de compostos que, embora não interajam diretamente com o TAF9B, são capazes de modular as vias e processos celulares que podem levar a uma melhoria da sua função na maquinaria de transcrição. Por exemplo, a forskolina, ao aumentar os níveis celulares de cAMP, ativa a proteína quinase A (PKA), que pode fosforilar vários substratos, incluindo factores de transcrição que podem interagir com o TAF9B, reforçando assim o seu papel no complexo TFIID. Do mesmo modo, o 12-miristato 13-acetato de forbol (PMA) ativa a proteína quinase C (PKC), que também fosforila proteínas envolvidas na regulação da transcrição, potencialmente co-activando o TAF9B no complexo de iniciação da transcrição.
Além disso, compostos como a tricostatina A e o butirato de sódio são conhecidos inibidores da HDAC, o que pode levar a alterações na estrutura da cromatina, tornando-a mais acessível à maquinaria de transcrição. Essa maior acessibilidade pode melhorar a eficiência do TAF9B como parte do complexo TFIID no início da transcrição. A 5-Azacitidina e a S-Adenosilmetionina estão envolvidas nos processos de metilação e desmetilação do ADN e das histonas. Estas modificações são cruciais para a regulação da expressão génica. Ao alterar o estado de metilação, estes produtos químicos podem potencialmente afetar a ligação do TAF9B ao ADN e a sua atividade na iniciação da transcrição.
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