Os inibidores da SULT1B1 funcionam predominantemente através da ligação ao local ativo da enzima SULT1B1, impedindo assim a sua atividade normal de sulfatação. Compostos como a quercetina, um flavonoide natural, podem competir com os substratos no local de ligação de várias sulfotransferases, incluindo a SULT1B1. Do mesmo modo, os AINE, incluindo o ácido mefenâmico, o naproxeno e a indometacina, demonstraram tendências inibitórias em relação a algumas enzimas sulfotransferases. Funcionam imitando o substrato e ocupando assim o sítio ativo da enzima.
Além disso, compostos como o ácido salicílico e o bisfenol A podem interferir nos processos de sulfatação, influenciando assim a atividade da SULT1B1. Os compostos naturais, como a naringenina, e os compostos endógenos, como a DHEA (dehidroepiandrosterona), apresentam os seus efeitos inibitórios através da ligação competitiva aos sítios activos de determinadas SULT. Outros inibidores notáveis incluem o tamoxifeno e a daunorrubicina, que, embora não sejam inibidores primários das SULT, podem apresentar efeitos inibitórios em determinados membros da sulfotransferase. O estradiol, uma hormona esteroide endógena, pode também impedir certas SULT ao competir pelo local ativo.
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