Os inibidores químicos do SGS2 podem funcionar através de vários mecanismos, principalmente visando a atividade da cinase, que é central para a função da proteína. A esturosporina actua como um potente inibidor das proteínas cinases, incluindo a SGS2, ligando-se ao local de ligação do ATP da proteína. Esta ligação impede que o ATP se associe à SGS2, impedindo assim a transferência de um grupo fosfato para os substratos da proteína e inibindo eficazmente a atividade de fosforilação da SGS2. Do mesmo modo, o imatinib, conhecido pela sua especificidade em relação a determinadas tirosina-quinases, pode inibir o SGS2 ligando-se ao seu domínio tirosina-quinase, se este estiver presente, impedindo também os eventos de fosforilação. O Dasatinib, com o seu amplo espetro de inibição da tirosina cinase, ligar-se-ia ao local de ligação ao ATP do SGS2, assumindo a semelhança estrutural do SGS2 com as tirosina cinases, o que resultaria na obstrução da ativação da cinase e subsequente sinalização a jusante.
Outros inibidores, como o erlotinib e o lapatinib, têm como alvo os domínios da tirosina cinase do EGFR. Se o SGS2 interagir com o EGFR ou tiver domínios semelhantes, estes inibidores podem ligar-se ao SGS2 e interromper a sua atividade. O sorafenib, o sunitinib, o pazopanib, o vandetanib e o lenvatinib inibem as cinases envolvidas na sinalização dos factores de crescimento; se o SGS2 fizer parte das vias de sinalização reguladas por estas cinases, estes inibidores interromperiam a função do SGS2 impedindo a ligação do ATP à proteína. A inibição selectiva do nilotinib de cinases como o BCR-ABL pode estender-se ao SGS2 se este partilhar características ou interagir com essas cinases, levando à prevenção da atividade cinase do SGS2. Por último, o bosutinib tem como alvo as tirosina-quinases da família Src e as quinases ABL. Se a função ou a estrutura da SGS2 estiver relacionada com estas cinases, o bosutinib pode inibir a atividade da SGS2 ligando-se ao seu local de ligação ao ATP, bloqueando assim a fosforilação dos alvos a jusante e inibindo eficazmente a atividade cinase da proteína SGS2.
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