Os activadores químicos da RUNDC3B estão envolvidos na regulação da atividade desta proteína através de várias vias de sinalização. A bisindolilmaleimida I, como inibidor da proteína quinase C (PKC), pode levar à ativação da RUNDC3B, alterando o panorama de fosforilação na célula. Quando a PKC é inibida, há uma mudança no equilíbrio da atividade da quinase, que pode resultar na ativação da RUNDC3B através de efeitos a jusante. Do mesmo modo, o Gö 6983 e o GF 109203X, ambos inibidores da PKC de largo espetro, podem também promover a ativação da RUNDC3B modificando as cascatas de sinalização da quinase. Esta alteração pode ativar o RUNDC3B à medida que a célula tenta manter a homeostase da sinalização. A inibição das vias da MAP quinase, como com o SB 203580, um inibidor da p38 MAP quinase, e o U0126, um inibidor da MEK, também pode resultar na ativação de vias alternativas que incluem o RUNDC3B. A célula compensa a via inibida através da ativação de RUNDC3B, facilitando a continuação das funções celulares que dependem da sinalização MAPK.
Além disso, o LY294002 e a Wortmannin, ambos inibidores da PI3K, podem ativar a RUNDC3B através de mecanismos de compensação celular. A inibição da PI3K leva a um redireccionamento dos sinais para manter as funções celulares essenciais, e a RUNDC3B pode ser activada como parte desta resposta. Do mesmo modo, a triciribina, um inibidor da Akt, também pode levar à ativação da RUNDC3B, uma vez que a célula compensa a perda da sinalização da Akt. Esta resposta compensatória pode incluir a ativação de RUNDC3B para preservar a sinalização através da via PI3K/Akt. Além disso, a inibição de outras cinases, como a JNK com SP600125, a MEK com PD 98059 e a ROCK com Y-27632, também pode levar à ativação da RUNDC3B, uma vez que a célula utiliza mecanismos de sinalização alternativos. Por último, a rapamicina, um inibidor do mTOR, pode ativar o RUNDC3B através da complexa interação do mTOR com vários processos celulares, incluindo a síntese de proteínas e o crescimento celular, em que o RUNDC3B pode desempenhar um papel na resposta celular ajustada à inibição do mTOR.
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