Os compostos capazes de aumentar a atividade do RBM41 operam através de uma variedade de mecanismos bioquímicos para influenciar o seu estado funcional. Os agentes que estimulam a adenilil ciclase para aumentar os níveis intracelulares de AMPc podem levar à ativação da PKA e de outras vias de resposta ao AMPc, alterando potencialmente a afinidade de ligação ao ARN ou a localização celular do RBM41. Do mesmo modo, os compostos que actuam como inibidores da fosfodiesterase contribuem para a elevação do AMPc, o que pode ter um impacto semelhante no estado de fosforilação das proteínas associadas ao RBM41, modificando assim as suas interacções com outros factores celulares. Além disso, foi demonstrado que a aplicação de poliaminas modula a função das proteínas de ligação ao ARN, o que pode aumentar a atividade do RBM41, estabilizando a sua estrutura ou influenciando a sua ligação aos ARN-alvo.
Outras moléculas exercem os seus efeitos através da modulação dos níveis de cálcio intracelular, quer actuando como ionóforos, quer activando diretamente cinases dependentes do cálcio, o que pode levar à fosforilação do RBM41, influenciando indiretamente a sua atividade. Sabe-se que certos compostos fenólicos activam as sirtuínas, o que pode alterar o estado de acetilação das proteínas de ligação ao ARN, incluindo o RBM41, aumentando assim a sua ligação ao ARN ou a sua interação com outras proteínas. Além disso, os moduladores da via de sinalização que afectam a atividade da quinase podem levar a alterações nos padrões de fosforilação de proteínas como a RBM41, aumentando potencialmente a sua capacidade de ligação ao ARN. A inibição da via do NF-κB por compostos específicos pode também desempenhar um papel na modulação da atividade das proteínas de ligação ao ARN, levando a alterações na sua localização celular ou nas interacções proteína-proteína que resultam na ativação funcional do RBM41.
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