Os inibidores químicos da PRDM10 podem atuar através de vários mecanismos que perturbam o papel da proteína na regulação da transcrição e na remodelação da cromatina. A estauroporina, por exemplo, é um potente inibidor da proteína quinase e, ao inibir as quinases, pode perturbar os eventos de fosforilação a jusante que são cruciais para a atividade da PRDM10. Ao bloquear estas vias de fosforilação, a estauroporina pode inibir a ativação funcional do PRDM10, que é necessária para o seu papel de co-regulador da transcrição. Do mesmo modo, a alsterpaulona tem como alvo as cinases dependentes da ciclina (CDK), que são fundamentais na progressão do ciclo celular e podem estar indiretamente envolvidas na regulação da atividade do PRDM10, afectando a maquinaria transcricional e impedindo potencialmente que o PRDM10 desempenhe as suas funções de modulação da expressão genética.
A inibição das histonas desacetilases (HDAC) representa outra estratégia para impedir a função do PRDM10. Compostos como a tricostatina A, o entinostato, o vorinostato, a romidepsina, o panobinostato, o mocetinostato e o belinostato podem aumentar os níveis de acetilação das histonas, o que pode alterar a paisagem da cromatina, dificultando potencialmente a capacidade da PRDM10 para aceder ou modificar a cromatina. Esta alteração da estrutura da cromatina pode inibir a capacidade da PRDM10 de regular eficazmente a expressão genética. De forma semelhante, produtos químicos como a 5-azacitidina e o RG108 inibem as metiltransferases do ADN (DNMTs), levando à hipometilação do ADN. Uma vez que a PRDM10 está implicada no reconhecimento ou colocação de marcas epigenéticas, essa hipometilação pode perturbar os contextos genómicos em que a PRDM10 opera, inibindo assim a sua influência reguladora sobre a expressão genética. Ao visar estas enzimas específicas que modificam a cromatina, estes inibidores podem criar um ambiente em que a PRDM10 não pode exercer eficazmente as suas funções reguladoras, levando à sua inibição funcional.
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