Os inibidores químicos da PODNL1 podem exercer os seus efeitos através de várias vias moleculares, visando enzimas e cinases específicas envolvidas na sua regulação. A Wortmannin e o LY294002 são inibidores que visam diretamente as fosfoinositídeo 3-quinases (PI3K), que são reguladores a montante na cascata de sinalização que conduz à ativação da PODNL1. Ao inibir a PI3K, estes produtos químicos impedem a fosforilação e a subsequente ativação da PODNL1, reduzindo assim a sua atividade na célula. O SB203580 funciona através da inibição selectiva da p38 MAP quinase, outra molécula das vias de sinalização que afectam a atividade da PODNL1. Ao interromper a função da p38 MAP quinase, o SB203580 pode diminuir a sinalização que contribui para o estado funcional da PODNL1.
Do mesmo modo, o composto SP600125 inibe a via de sinalização da c-Jun N-terminal quinase (JNK), que pode regular proteínas que partilham semelhanças funcionais com a PODNL1. Ao bloquear a JNK, o SP600125 pode diminuir a atividade da PODNL1. O PD98059 e o U0126 têm como alvo a proteína quinase activada por mitogénio (MEK), com o PD98059 a inibir a MEK1 e o U0126 a inibir tanto a MEK1 como a MEK2. A inibição da MEK leva a uma redução da atividade da via da quinase regulada por sinal extracelular (ERK), que está potencialmente envolvida na regulação da PODNL1. O PP2 e o Dasatinib, por outro lado, são inibidores das tirosina quinases da família Src, que podem influenciar várias vias de sinalização, incluindo as que envolvem a PODNL1. Ao inibir estas cinases, tanto o PP2 como o Dasatinib podem reduzir a atividade funcional da PODNL1. O BIBF 1120, ou Nintedanib, tem como alvo múltiplos receptores tirosina quinases, como o VEGFR, o PDGFR e o FGFR, que podem modular as vias que regulam a PODNL1, levando à diminuição da atividade da proteína. O Y-27632 é um inibidor seletivo da proteína cinase associada a Rho (ROCK), parte da via Rho/ROCK que intersecta as vias de sinalização da PODNL1, pelo que a sua inibição também resulta numa redução da atividade da PODNL1. Por último, o KN-93 e o Go6983 inibem a proteína quinase II dependente de cálcio/calmodulina (CaMKII) e a proteína quinase C (PKC), respetivamente, ambas envolvidas em cascatas de sinalização que podem regular a função da PODNL1, e a sua inibição pode levar a uma diminuição da atividade da PODNL1.
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