A forskolina e o IBMX funcionam principalmente através da modulação dos níveis de AMPc e da subsequente ativação da PKA, que é um interveniente fundamental na fosforilação das proteínas. O estado de fosforilação das proteínas pode determinar de forma crítica a sua função, localização e interação com outros componentes celulares, razão pela qual a ativação da PKA é considerada um modulador significativo da função das proteínas, incluindo a da PDXDC1. Por outro lado, a PMA é um ativador direto da PKC, outra quinase que fosforila um amplo espetro de proteínas, incluindo potencialmente as que se associam à PDXDC1.
Os inibidores da quinase, como o LY294002, a Wortmannin, o PD98059, o U0126, o SP600125 e o SB203580, têm como alvo diferentes quinases no interior da célula. A inibição destas cinases afecta várias vias de sinalização, tais como PI3K/AKT, MEK/ERK, JNK e p38 MAPK, todas elas fundamentais para regular numerosos aspectos da função celular, incluindo a atividade proteica e a expressão genética. A rapamicina e o KN-93 representam modalidades adicionais de ativação indireta. A inibição da sinalização mTOR pela rapamicina pode conduzir a uma vasta gama de respostas celulares que podem afetar indiretamente a PDXDC1, enquanto a inibição da CaMKII pelo KN-93 altera a sinalização do cálcio, que é um processo ubíquo e vital nas células, influenciando numerosas proteínas e vias, incluindo potencialmente as associadas à PDXDC1.
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