Os activadores MKS3 englobam uma variedade de compostos químicos que estimulam indiretamente a atividade funcional do MKS3 através de várias vias de sinalização distintas. A forskolina, a toxina da cólera, a milrinona, o IBMX, a piritiona de zinco e o Dibutiril AMPc funcionam para elevar os níveis de AMPc intracelular, levando à ativação da PKA. Esta ativação pode resultar na fosforilação de várias proteínas que interagem com a proteína MKS3, reforçando assim o seu papel na função e sinalização ciliar. Os inibidores da PDE, especificamente, impedem a quebra do AMPc, apoiando um sinal sustentado da PKA que pode atuar nas vias da MKS3. Além disso, o GTPγS actua como ativador da proteína G, e esta ativação persistente poderia modificar a sinalização dos receptores acoplados à proteína G, afectando potencialmente as vias reguladas pela MKS3.
Além disso, o uso de L-Arginina e doador de óxido nítrico - nitroprussiato de sódio leva à produção de óxido nítrico, que pode elevar os níveis de GMPc, aumentando assim os mecanismos de sinalização que podem ativar indiretamente o MKS3 envolvido no movimento ciliar ou nas funções sensoriais. O AICAR, mimetizando o monofosfato de adenosina, ativa a AMPK, que pode influenciar a atividade do MKS3 através do balanço energético e de sinais metabólicos. A ação do ionóforo de cálcio A23187 aumenta os níveis de cálcio intracelular, podendo afetar a CaMK e, subsequentemente, a sinalização relacionada com MKS3 nos cílios. Por último, o ativador Epac, 8-pCPT-2'-O-Me-cAMP, tem como alvo específico o Epac, que pode modular diferentes vias dependentes do AMPc, com potencial impacto na atividade funcional do MKS3 no contexto dos processos de manutenção e sinalização ciliar. Coletivamente, estes activadores funcionam através de vias bioquímicas que convergem ou influenciam a atividade do MKS3, reforçando assim o seu papel na biologia ciliar sem aumentar diretamente a sua expressão ou através de ativação geral.
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