Os inibidores químicos da LRFN2 funcionam através da interação com várias vias de sinalização e cinases que são cruciais para o papel da proteína na sinalização sináptica e na plasticidade. Os inibidores da quinase da família Src, como o PD173955, o PP2, o Dasatinib e o SU6656, têm como alvo direto as tirosina-quinases da família Src, conhecidas por fosforilarem substratos envolvidos na modulação da formação e manutenção das sinapses. Estes inibidores impedem a ativação das cinases Src, reduzindo assim potencialmente a fosforilação de proteínas nas vias de sinalização em que o LRFN2 está envolvido. Por exemplo, o PD173955 pode levar a uma diminuição das interacções funcionais do LRFN2 com os seus parceiros sinápticos, enquanto a inibição de largo espetro do Dasatinib pode afetar a adesão celular e a plasticidade sináptica, processos em que o LRFN2 desempenha um papel importante. O SU6656, por ser mais seletivo, afecta especificamente a sinalização relacionada com a função do LRFN2 na regulação sináptica.
Por outro lado, inibidores como o Lapatinib e o Gefitinib têm como alvo as vias de sinalização ErbB e EGFR, respetivamente, que podem influenciar processos como o crescimento da neurite e a plasticidade sináptica, onde o LRFN2 tem sido implicado. Ao inibir estas vias, o Lapatinib e o Gefitinib podem reduzir as actividades associadas ao LRFN2 nestes domínios. O inibidor de MEK U0126 e o inibidor de JNK SP600125 interferem com as vias MAPK/ERK e JNK, respetivamente, que são vias que o LRFN2 pode utilizar. O U0126 pode inibir os eventos de sinalização mediados pelo LRFN2 ligados à via MAPK/ERK, enquanto o SP600125 inibiria o papel do LRFN2 em processos influenciados pela JNK. O SB203580, um inibidor da MAP quinase p38, afectaria as funções relacionadas com o LRFN2 ao inibir a sinalização da MAPK p38 envolvida nas alterações sinápticas. Os inibidores da via PI3K/Akt LY294002 e Wortmannin impediriam a via crucial para a formação e manutenção de sinapses, inibindo assim a função do LRFN2 nestes processos sinápticos. Por último, a rapamicina, um inibidor da mTOR, impediria a sinalização da mTOR, que é importante para a plasticidade sináptica e o crescimento dos neurónios, áreas em que se nota a influência do LRFN2. Cada um destes inibidores visa interacções moleculares específicas e cascatas de sinalização que são fundamentais para o papel do LRFN2 no neurónio.
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