Os compostos como o LY294002 e a wortmannina podem impedir a via de sinalização PI3K/Akt, que é fundamental para a sobrevivência e o metabolismo das células. Ao fazê-lo, estes inibidores podem afetar indiretamente proteínas que são reguladas por esta via ou que dela dependem. Do mesmo modo, o U0126, o PD98059 e o SB203580 foram concebidos para atacar as cinases das vias MAPK/ERK e p38 MAP cinase, respetivamente. Estas vias são essenciais para o crescimento celular, a diferenciação e a resposta do organismo ao stress e à inflamação.
Por outro lado, os inibidores como a rapamicina, que têm como alvo a sinalização mTOR, podem afetar os processos celulares relacionados com o crescimento e o metabolismo. Agentes como o SP600125, que inibe a JNK, podem afetar a apoptose e o sistema imunitário, modulando a atividade de proteínas envolvidas nestes processos. O NF449, que inibe a subunidade Gs-alfa, pode alterar a sinalização dependente do AMP cíclico, e o BAPTA-AM, ao quelar o cálcio intracelular, pode afetar vários processos dependentes do cálcio. O papel da tapsigargina na perturbação da homeostase do cálcio através da inibição da SERCA pode influenciar numerosas vias de sinalização dependentes do cálcio. Por último, a 2-desoxi-D-glicose, ao inibir a glicólise, pode alterar o metabolismo energético celular, afectando potencialmente as proteínas que dependem ou regulam as vias metabólicas.
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