Os inibidores, como a Wortmannin e o LY294002, actuam sobre as fosfoinositídeo 3-quinases (PI3K), reguladores essenciais das vias de sinalização intracelular relacionadas com o crescimento, a proliferação e a sobrevivência. A inibição da PI3K leva a uma perturbação da sinalização subsequentes que pode afetar a função e a regulação das proteínas. A rapamicina, que se liga ao alvo mecanicista da rapamicina (mTOR), influencia a síntese e a degradação das proteínas, alterando assim possivelmente a taxa de renovação das proteínas, incluindo o LOC284023. Os compostos que têm como alvo a via MAPK/ERK, como U0126, SB203580 e PD98059, podem levar a perfis de expressão genética alterados e modificar as respostas ao stress celular, o que pode ter um efeito subsequentes na função ou estabilidade de várias proteínas. Sabe-se que os inibidores da via JNK, como o SP600125, afectam a resposta ao stress celular, o que pode influenciar a expressão e a função de proteínas envolvidas na resposta a alterações ambientais.
Os inibidores do proteassoma, como o bortezomib e o MG132, perturbam a degradação das proteínas marcadas com ubiquitina, conduzindo potencialmente a níveis elevados de certas proteínas, o que pode interferir com a renovação e a função normais das proteínas. O ZM447439, ao inibir as cinases Aurora, afecta o alinhamento e a segregação cromossómica durante a mitose, o que pode influenciar as proteínas associadas à divisão celular. O dasatinib, através da sua inibição das cinases da família Src, tem um amplo impacto nas vias de sinalização da adesão, crescimento e diferenciação celular, podendo todas elas modular a função e a estabilidade das proteínas. O gefitinib, um inibidor da tirosina quinase do EGFR, afecta a sinalização do fator de crescimento, que é crucial para regular a expressão e a função das proteínas.
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