A proteína designada como LETM2 está hipoteticamente envolvida em processos celulares com base na sua nomenclatura, o que pode sugerir uma função relacionada com a LETM1, uma proteína conhecida que faz parte da família das proteínas transmembranares com zíper de leucina e mão-EF. Se LETM2 seguir a caraterização de outros membros da família LETM, poderá desempenhar um papel na regulação do volume mitocondrial e na manutenção do gradiente eletroquímico através da membrana interna mitocondrial. O LETM2, por analogia, poderia ser parte integrante do transporte de catiões, potencialmente iões de cálcio ou magnésio, influenciando assim a bioenergética mitocondrial e as vias de sinalização.
A proteína pode conter domínios EF-hand, que são característicos das proteínas de ligação ao cálcio, sugerindo um papel potencial na sinalização do cálcio. Além disso, a presença de um motivo de fecho de correr de leucina indicaria que a LETM2 poderia participar em interacções proteína-proteína, possivelmente formando complexos homo- ou hetero-oligoméricos que são essenciais para a sua função. O mau funcionamento ou mutações no gene LETM2 podem estar associados a doenças mitocondriais, défices de energia celular ou outras condições fisiopatológicas.
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