Os inibidores químicos do KLRF2 estabelecem uma série de interacções que resultam na inibição funcional desta proteína. A ciclosporina A, através da sua ação imunossupressora, inibe a calcineurina que, normalmente, estaria subsequentes às vias de ativação das células T onde o KLRF2 pode estar implicado. A ligação da ciclosporina A às ciclofilinas e a subsequente inibição da produção de IL-2 podem levar a uma redução da ativação das células T, afectando assim indiretamente o funcionamento do KLRF2. Outro composto, o Dasatinib, actua como inibidor da tirosina quinase e obstrui as quinases BCR-ABL e da família Src, que estão envolvidas em vias de sinalização que provavelmente se cruzam com o papel do KLRF2. Do mesmo modo, o PP2, como inibidor da quinase da família Src, interromperia as vias de sinalização essenciais para a função das células imunitárias onde o KLRF2 está potencialmente ativo.
A rapamicina e a Wortmannin actuam nas vias mTOR e PI3K/AKT, respetivamente, cruciais para a proliferação e sobrevivência das células. A inibição da mTOR pela rapamicina pode reduzir a atividade dos processos celulares que envolvem o KLRF2, enquanto a inibição da PI3K pela Wortmannin perturba a sinalização AKT/mTOR, levando ambas a uma inibição funcional indireta do KLRF2. O Ly294002, outro inibidor da PI3K, interrompe de forma semelhante a via AKT/mTOR. O U0126 e o PD98059, que são inibidores da MEK, e o SB203580, um inibidor da p38 MAPK, interferem com as vias da MAPK. Ao impedir a ativação de MEK1/2 e p38 MAPK, estes inibidores podem impedir processos celulares que requerem a sinalização MAPK/ERK, onde o KLRF2 pode estar envolvido. O SP600125 tem como alvo a JNK, que faz parte das vias de sinalização MAPK, e a sua inibição pode perturbar as vias necessárias para a função do KLRF2. Por último, o sorafenib e o imatinib, que são inibidores multi-quinase, têm como alvo várias quinases em diferentes vias de sinalização. O sorafenib tem como alvo as cinases RAF e o imatinib inibe as cinases BCR-ABL, c-KIT e PDGFR, o que pode levar à perturbação das cascatas de sinalização necessárias para o funcionamento das células imunitárias e, consequentemente, à inibição funcional do KLRF2.
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