Os inibidores químicos da KLKb2 incluem uma variedade de compostos que impedem a função da proteína através de diferentes mecanismos de ação. A aprotinina actua formando um complexo com o domínio da protease do KLKb2, obstruindo assim o local ativo e impedindo-o de se ligar aos substratos peptídicos. Do mesmo modo, a benzamidina compete com os substratos naturais na ligação ao local ativo da KLKb2, conseguindo a inibição através da imitação da estrutura do substrato. O AEBSF inibe a KLKb2 de forma irreversível, ligando-se covalentemente ao resíduo de serina no local ativo, que é crucial para a atividade proteolítica da enzima. A leupeptina, por outro lado, liga-se reversivelmente ao local ativo e bloqueia a hidrólise das ligações peptídicas, inibindo assim a atividade da KLKb2.
O gabexato e o camostato mimetizam o estado de transição da hidrólise das ligações peptídicas para ocupar o local ativo da KLKb2, impedindo a interação da proteína com os seus substratos e inibindo a sua função. O nafamostato também se liga ao sítio ativo de forma semelhante ao Camostato, impedindo a divisão do substrato e inibindo subsequentemente a atividade enzimática da KLKb2. A quimostatina funciona ocupando o sítio ativo para impedir a atividade proteolítica do KLKb2. O inibidor de tripsina de soja (SBTI) visa diretamente o KLKb2 ligando-se ao seu sítio ativo, inibindo a capacidade da enzima para processar substratos. O E-64, embora iniba tipicamente as cisteíno-proteases, pode inibir a KLKb2 ligando-se irreversivelmente ao seu sítio ativo devido à ampla especificidade da protease, o que leva à inibição da função catalítica. A pepstatina A, que é geralmente um inibidor da protease aspártica, pode inibir o KLKb2 ligando-se ao seu sítio ativo. Finalmente, o fosforamidon pode inibir o KLKb2 quelando iões metálicos essenciais para a integridade estrutural da protease ou para a ligação protéica ao substrato, inibindo assim a função proteolítica da proteína. Entre esses produtos químicos, cada um visa a atividade proteolítica do KLKb2 através de interacções específicas com o local ativo ou com componentes estruturais essenciais da enzima, levando à inibição funcional.
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