O papel do KLF12 como fator de transcrição em vários contextos celulares torna-o um alvo de interesse para a modulação por diversas vias bioquímicas. Os activadores indirectos do KLF12 podem incluir compostos que alteram a sinalização celular ou o estado epigenético, afectando assim a expressão do KLF12 ou a sua atividade nos genes alvo. Agentes como o ácido retinóico, todos os trans, e a 5-Aza-2′-desoxicitidina podem influenciar o KLF12 ao alterar o estado de diferenciação das células ou o panorama epigenético, respetivamente. O ácido retinóico, todo trans, através do seu papel na diferenciação celular, pode alterar as exigências transcricionais do KLF12, levando a alterações na sua atividade. Do mesmo modo, a 5-Aza-2′-Deoxicitidina poderia reativar genes epigeneticamente silenciados, incluindo possivelmente o próprio KLF12 ou os seus genes-alvo, afectando assim o seu papel funcional na célula.
Outros compostos, como a tricostatina A, a forskolina e o PMA, actuam através da modificação das histonas, da sinalização do AMPc e da ativação da PKC, respetivamente, alterando potencialmente o ambiente celular em que o KLF12 funciona. O efeito da tricostatina A na cromatina pode tornar certos genes mais acessíveis a factores de transcrição como o KLF12, alterando a sua capacidade de regular a expressão genética. A forskolina e o PMA, ao modificarem as vias de sinalização, podem levar a alterações no estado de fosforilação do KLF12 ou dos seus cofactores, alterando a sua atividade. Por outro lado, compostos como a rapamicina e o cloreto de lítio afectam vias mais amplas de crescimento celular e de sinalização, alterando potencialmente a expressão ou a procura do KLF12 em processos como o crescimento celular, a apoptose e a resposta ao stress celular. Cada um destes compostos representa uma via possível através da qual a atividade ou a expressão do KLF12 pode ser modulada, reflectindo a natureza interligada das vias de sinalização, da regulação transcricional e do contexto celular na determinação da função de factores de transcrição fundamentais como o KLF12.
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