Os inibidores químicos seleccionados para o KIAA1731 visam uma variedade de processos celulares e vias de sinalização, cada um com um mecanismo de ação distinto. Incluem inibidores da cinase, como a Staurosporina e o PP2, que podem impedir os eventos de fosforilação que podem envolver o KIAA1731. Nos casos em que o KIAA1731 desempenha um papel em vias relacionadas com a cinase, como PI3K/Akt, JNK ou MEK/ERK, inibidores como LY294002, SP600125 e PD98059 podem revelar-se eficazes na sua função. Alguns inibidores, como o U0126, apresentam uma especificidade dupla em relação aos seus alvos, oferecendo assim uma gama mais vasta de pontos de interação com o KIAA1731, caso este funcione dentro dessas vias de sinalização. Os compostos como a rapamicina, que têm como alvo a deteção de nutrientes e a regulação metabólica através da via mTOR, podem limitar a atividade do KIAA1731 se este atuar nos processos metabólicos.
Os inibidores que são mais especializados na sua ação, como o IWP-2 para a sinalização Wnt ou o DAPT para a sinalização Notch, chamam a atenção para as vias relacionadas com o desenvolvimento e a diferenciação em que o KIAA1731 pode funcionar. Dada a possibilidade de envolvimento do KIAA1731 na migração celular ou em alterações morfológicas, o inibidor da ROCK Y-27632 e o inibidor do recetor de TGF-beta SB431542 cobrem essas actividades celulares. É importante salientar que os inibidores são escolhidos com base no pressuposto de que a KIAA1731 participa numa ou em várias destas vias e servem como ferramentas para dissecar o papel funcional da proteína no contexto celular mais alargado.
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