KIAA1731のために選択された化学阻害剤は、様々な細胞プロセスやシグナル伝達経路を標的とし、それぞれが異なる作用機序を持つ。これらには、KIAA1731に関与する可能性のあるリン酸化事象を阻害することができるStaurosporineやPP2のようなキナーゼ阻害剤が含まれる。KIAA1731がPI3K/Akt、JNK、またはMEK/ERKのようなキナーゼ関連経路で役割を果たしている場合、LY294002、SP600125、PD98059のような阻害剤がその機能において効果的であることが証明できる。U0126のように、標的に対して二重特異性を示す阻害剤もあり、KIAA1731がこれらのシグナル伝達経路で機能する場合、相互作用ポイントの幅が広がる。ラパマイシンのような化合物は、mTOR経路を介した栄養感知と代謝調節を標的としており、KIAA1731が代謝過程に作用する場合、その活性を制限することができる。
Wntシグナル伝達に対するIWP-2やNotchシグナル伝達に対するDAPTのような、作用がより特化した阻害剤は、KIAA1731が機能する可能性のある発生や分化に関連した経路に焦点を当てる。KIAA1731が細胞遊走や形態変化に関与している可能性を考慮すると、ROCK阻害剤Y-27632とTGF-β受容体阻害剤SB431542が、それらの細胞活動をカバーする。重要なことは、これらの阻害剤は、KIAA1731がこれらの経路の1つまたは複数に関与しているという仮定に基づいて選択されており、より広範な細胞状況の中でのタンパク質の機能的役割を解明するためのツールとして役立っていることである。
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