Os inibidores químicos do KCTD15 podem modular várias vias de sinalização que, em última análise, conduzem à sua inibição funcional. O Ro 25-6981, por exemplo, actua como um antagonista seletivo dos receptores NMDA, bloqueando diretamente as subunidades dos receptores envolvidos nas vias neurais às quais o KCTD15 está associado, inibindo assim o papel do KCTD15 na sinalização neuronal. Paralelamente, o SB-216763, um potente inibidor da GSK-3beta na via de sinalização Wnt, pode suprimir os processos fisiológicos que o KCTD15 influencia através da inibição de uma quinase que regula indiretamente a função do KCTD15 no desenvolvimento neuronal. O Y-27632, um inibidor da ROCK, interrompe a dinâmica do citoesqueleto, que é essencial para os processos celulares que se sabe que o KCTD15 afecta. A inibição funcional da KCTD15 resulta da alteração destas vias relacionadas com a morfologia celular.
Além disso, a via MAPK, na qual o KCTD15 está implicado, pode ser alvo de PD 98059 e U0126, que são inibidores da MEK, e de SP600125, que inibe a JNK. Estes produtos químicos impedem a ativação de efectores a jusante, como a ERK, levando à atenuação da atividade funcional da KCTD15. Do mesmo modo, a inibição da p38 MAPK pelo SB203580 tem impacto no KCTD15, afectando o papel da proteína nas respostas celulares moduladas pela via da MAPK. Os inibidores da PI3K, como o LY294002 e a Wortmannin, juntamente com o inibidor da mTOR Rapamicina, impedem o eixo de sinalização PI3K/AKT/mTOR, que é crucial para os processos em que a KCTD15 é um interveniente fundamental. O resultado funcional destas inibições é uma diminuição da atividade da KCTD15 nestas vias de sinalização. Além disso, os inibidores da PKC, como a Bisindolilmaleimida I e o Go 6983, suprimem as vias mediadas pela PKC, que são importantes para os mecanismos reguladores em que a KCTD15 está envolvida, levando assim à inibição funcional da atividade da KCTD15 nestas vias.
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