A atividade funcional do JAKMIP2 está intrinsecamente ligada ao equilíbrio dinâmico da montagem e desmontagem dos microtúbulos. Activadores químicos específicos podem influenciar este equilíbrio modulando as vias de sinalização celular e o estado de fosforilação de que JAKMIP2 faz parte. Por exemplo, os compostos que aumentam os níveis intracelulares de AMPc levam à ativação de cinases, como a proteína quinase A, que por sua vez pode fosforilar substratos que estabilizam os microtúbulos, aumentando o envolvimento de JAKMIP2 com a rede de microtúbulos. Do mesmo modo, os activadores que aumentam as concentrações de cálcio intracelular podem ativar cinases dependentes de cálcio/calmodulina, que podem alterar o estado de fosforilação de proteínas associadas à dinâmica dos microtúbulos, promovendo potencialmente o papel de JAKMIP2 neste contexto. Por outro lado, a inibição de proteínas fosfatases por determinados químicos assegura um ambiente de fosforilação acrescido no interior das células, o que poderá contribuir para a manutenção da integridade dos microtúbulos e, indiretamente, aumentar a atividade de JAKMIP2 associada a estas estruturas.
Por outro lado, os agentes que interagem diretamente com a tubulina podem também ter um impacto indireto no papel do JAKMIP2. Por exemplo, os agentes que têm como alvo os microtúbulos e que os desestabilizam ou estabilizam podem criar uma resposta celular que compensa estes efeitos, levando a uma maior dinâmica dos microtúbulos e a um envolvimento potencialmente mais pronunciado de JAKMIP2 na estabilização destes componentes críticos do citoesqueleto. Alguns compostos ligam-se à tubulina, impedindo a sua polimerização; esta perturbação pode provocar uma resposta celular que favorece a montagem e a estabilidade dos microtúbulos, aumentando assim a atividade de JAKMIP2 na ligação e regulação dos microtúbulos. Por outro lado, outras substâncias estabilizam os microtúbulos ligando-se à β-tubulina, o que pode, paradoxalmente, resultar num ambiente celular que favorece o papel de JAKMIP2 na interação e manutenção dos microtúbulos. Adicionalmente, a modulação da atividade da cinase através da inibição da glicogénio sintase cinase-3 (GSK-3) pode levar a uma alteração no panorama de fosforilação das proteínas associadas aos microtúbulos, influenciando ainda mais a atividade de JAKMIP2 na dinâmica dos microtúbulos.
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