HDC Inibidores

Os inibidores comuns da HDC incluem, entre outros, o ácido 4-bromo-3-hidroxibenzóico CAS 14348-38-0, a loratadina CAS 79794-75-5, a cimetidina CAS 51481-61-9, a famotidina CAS 76824-35-6 e a ranitidina CAS 66357-35-5.

Os inibidores da histona desacetilase (HDC) são uma classe de compostos que têm como alvo as histonas desacetilases, enzimas que desempenham um papel fundamental na regulação da expressão genética através da alteração da estrutura da cromatina. Estas enzimas removem os grupos acetilo dos resíduos de lisina das proteínas histonas, resultando numa estrutura de cromatina mais condensada e, consequentemente, numa atividade transcricional reduzida. A inibição das histonas desacetilases leva a uma acumulação de histonas acetiladas, o que promove uma conformação mais relaxada da cromatina, facilitando o acesso da maquinaria transcricional ao ADN e aumentando assim a expressão genética. Este mecanismo é fundamental para a regulação de genes envolvidos numa variedade de processos celulares, incluindo a progressão do ciclo celular, a apoptose e a diferenciação. A diversidade química dos inibidores da HDC é vasta, abrangendo tanto produtos naturais, como a tricostatina A e o vorinostato, como moléculas sintéticas, que são frequentemente classificadas com base na sua especificidade para diferentes classes de histona desacetilases.

A relação estrutura-atividade (SAR) dos inibidores da HDC é de grande interesse para a biologia química, uma vez que estes compostos apresentam frequentemente um domínio de ligação ao metal que interage com o ião zinco presente no local catalítico das histonas desacetilases, um ligante hidrofóbico que atravessa o canal que conduz ao local ativo e um domínio de reconhecimento de superfície que se liga a resíduos próximos da superfície da enzima. O grupo de ligação ao zinco é normalmente composto por ácidos hidroxâmicos, tióis ou ácidos carboxílicos, que se coordenam com o ião zinco, inibindo assim a atividade enzimática. O ligante hidrofóbico e os componentes de reconhecimento da superfície são cruciais para otimizar a afinidade e a seletividade da ligação a isoformas específicas da histona desacetilase. Ao modularem a atividade da histona desacetilase, os inibidores da HDC influenciam a paisagem epigenética das células, afectando várias proteínas associadas à cromatina e alvos não-histona, alterando assim os perfis de expressão genética de uma forma dependente do contexto. O estudo dos inibidores da HDC estende-se à compreensão dos seus papéis mais amplos na regulação epigenética, uma vez que fornecem ferramentas inestimáveis para investigar a dinâmica da cromatina e as modificações epigenéticas em diferentes contextos biológicos.