HDC Inhibidores

Los inhibidores comunes de la HDC incluyen, entre otros, el ácido 4-bromo-3-hidroxibenzoico CAS 14348-38-0, la loratadina CAS 79794-75-5, la cimetidina CAS 51481-61-9, la famotidina CAS 76824-35-6 y la ranitidina CAS 66357-35-5.

Los inhibidores de la histona desacetilasa (HDC) son una clase de compuestos dirigidos contra las histonas desacetilasas, enzimas que desempeñan un papel fundamental en la regulación de la expresión génica mediante la alteración de la estructura de la cromatina. Estas enzimas eliminan los grupos acetilo de los residuos de lisina de las proteínas histonas, lo que da lugar a una estructura de cromatina más condensada y, en consecuencia, a una menor actividad transcripcional. La inhibición de las histonas desacetilasas provoca una acumulación de histonas acetiladas, lo que favorece una conformación más relajada de la cromatina, facilitando el acceso de la maquinaria transcripcional al ADN y potenciando así la expresión génica. Este mecanismo es fundamental para la regulación de genes implicados en diversos procesos celulares, como la progresión del ciclo celular, la apoptosis y la diferenciación. La diversidad química de los inhibidores de las HDC es amplia y abarca tanto productos naturales, como la tricostatina A y el vorinostat, como moléculas sintéticas, que a menudo se clasifican en función de su especificidad para diferentes clases de histonas desacetilasas.

La relación estructura-actividad (SAR) de los inhibidores de las HDC es de gran interés en biología química, ya que estos compuestos suelen presentar un dominio de unión metálica que interactúa con el ion zinc presente en el sitio catalítico de las histonas deacetilasas, un enlazador hidrofóbico que se extiende por el canal que conduce al sitio activo y un dominio de reconocimiento superficial que se acopla con residuos cercanos a la superficie de la enzima. El grupo de unión al zinc suele estar compuesto por ácidos hidroxámicos, tioles o ácidos carboxílicos, que se coordinan con el ion zinc, inhibiendo así la actividad enzimática. El enlazador hidrofóbico y los componentes de reconocimiento superficial son cruciales para optimizar la afinidad de unión y la selectividad hacia isoformas específicas de histona desacetilasa. Al modular la actividad de la histona desacetilasa, los inhibidores de la HDC influyen en el paisaje epigenético de las células, afectando a diversas proteínas asociadas a la cromatina y a dianas no histónicas, alterando así los perfiles de expresión génica de forma dependiente del contexto. El estudio de los inhibidores de HDC se extiende a la comprensión de sus funciones más amplias en la regulación epigenética, ya que proporcionan herramientas inestimables para sondear la dinámica de la cromatina y las modificaciones epigenéticas en diferentes entornos biológicos.