Os activadores químicos do FLJ46688 podem iniciar várias vias de sinalização celular que conduzem à ativação funcional da proteína. A forskolina estimula diretamente a adenilil ciclase, aumentando os níveis intracelulares de cAMP. Este aumento do AMPc pode subsequentemente ativar a proteína quinase A (PKA), que por sua vez pode fosforilar e ativar a FLJ46688. Do mesmo modo, o isoproterenol, um agonista beta-adrenérgico, também eleva as concentrações de AMPc, promovendo assim a atividade da PKA e a potencial ativação subsequente do FLJ46688. Outra via envolve a modulação dos níveis de cálcio intracelular. A ionomicina, ao atuar como um ionóforo de cálcio, aumenta a concentração de cálcio no interior da célula. O cálcio elevado pode ativar várias cinases dependentes do cálcio capazes de fosforilar e, assim, ativar o FLJ46688. O mesmo mecanismo de ação pode ser atribuído ao A23187, outro ionóforo de cálcio.
Por outro lado, o forbol 12-miristato 13-acetato (PMA) é conhecido pela sua capacidade de ativar a proteína quinase C (PKC), que poderia fosforilar diretamente o FLJ46688. A calicilina A e o ácido ocadaico inibem as proteínas fosfatases, como a PP1 e a PP2A, levando a uma redução da taxa de desfosforilação das proteínas, incluindo a FLJ46688. Esta inibição pode resultar num aumento líquido da fosforilação e ativação do FLJ46688. A tapsigargina e a tunicamicina induzem o stress do retículo endoplasmático, que pode ativar cinases activadas pelo stress capazes de fosforilar o FLJ46688. A anisomicina ativa as proteínas quinases activadas pelo stress (SAPK), que também podem ter como alvo a fosforilação e a ativação de FLJ46688. Por último, a bisindolilmaleimida I, um inibidor da PKC, pode paradoxalmente ativar cinases alternativas devido a mecanismos celulares compensatórios, e o H-89, embora seja principalmente um inibidor da PKA, pode igualmente ativar vias compensatórias que conduzem à ativação do FLJ46688, demonstrando o intrincado equilíbrio nas redes de sinalização e o potencial diálogo cruzado entre diferentes cascatas de sinalização na regulação da função proteica.
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