Os inibidores químicos de FANK1 podem conseguir uma inibição funcional através de vários mecanismos, visando as vias de sinalização em que se sabe que o FANK1 participa. A esturosporina, um inibidor da proteína cinase de largo espetro, pode impedir a atividade cinase do FANK1, impedindo a fosforilação dos seus substratos, que é um passo crucial para a sua função. Do mesmo modo, a 5-Iodotubercidina, como inibidor da adenosina quinase, pode bloquear a fosforilação da adenosina, perturbando potencialmente o FANK1. O LY294002 e a Wortmannin, ambos inibidores da PI3K, podem suprimir a via de sinalização PI3K/Akt. O PD98059 e o U0126, que têm como alvo a MEK na via da MAP quinase, podem impedir a ativação do FANK1.
Além disso, o SP600125 actua como um inibidor da JNK e pode inibir funcionalmente o FANK1. O SB203580, ao inibir a p38 MAP quinase, também pode interferir com a atividade do FANK1. A rapamicina, um inibidor da mTOR, pode suprimir a função do FANK1. O PP2, que inibe as cinases da família Src, interromperia a sinalização da cinase Src, afectando subsequentemente a atividade do FANK1. Por último, o Gefitinib, que inibe especificamente a tirosina quinase EGFR, impediria a atividade do FANK1.
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