Os inibidores do DnaJB8 funcionam principalmente através da inibição das proteínas de choque térmico (HSPs) às quais o DnaJB8 se associa. O DnaJB8 é um acompanhante que ajuda na dobragem e maturação das proteínas, funcionando em complexos com HSP70 e HSP90. Por conseguinte, os inibidores destas HSPs podem levar a uma diminuição da atividade funcional do DnaJB8. A Geldanamicina, o 17-AAG e o Radicicol são todos inibidores da HSP90 que perturbam os complexos HSP70-HSP90, reduzindo assim a atividade funcional do DnaJB8. Ao inibir a HSP90, estes compostos perturbam os complexos acompanhantes, afectando o processo de dobragem e maturação das proteínas em que o DnaJB8 está envolvido.
De forma semelhante, o VER-155008, o MKT-077, o Apoptozole e o JG-98 são inibidores da HSP70 que, ao inibirem a HSP70, diminuem a atividade funcional do DnaJB8. Estes inibidores perturbam os complexos acompanhantes, conduzindo a uma diminuição da dobragem e maturação das proteínas, para as quais o DnaJB8 contribui. Além disso, alguns inibidores funcionam influenciando outras vias que afectam indiretamente a funcionalidade do DnaJB8. A cicloheximida inibe a síntese proteica e, por conseguinte, impede indiretamente o processo de dobragem de proteínas que o DnaJB8 auxilia. A tunicamicina inibe a glicosilação, uma modificação pós-tradução, afectando indiretamente o papel do DnaJB8 na dobragem e maturação das proteínas. O MG132 e o bortezomib são inibidores do proteassoma. Como o DnaJB8 pode participar em vias de degradação de proteínas, a alteração dessas vias pode afetar indiretamente a funcionalidade do DnaJB8.
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