Os inibidores químicos da CUEDC2 abrangem uma gama de substâncias que visam várias vias de sinalização com as quais a proteína interage. O LY294002 e a Wortmannin são inibidores que visam especificamente as fosfoinositídeos 3-quinases (PI3K). A ação destes inibidores pode impedir a PI3K de iniciar uma cascata de eventos de fosforilação. Como o CUEDC2 está envolvido na via PI3K, a inibição por esses produtos químicos resulta numa sinalização interrompida, o que, por sua vez, atenua o papel funcional do CUEDC2. Do mesmo modo, a rapamicina actua sobre a via mTOR, à qual o CUEDC2 está associado. Ao impedir a mTOR, a rapamicina inibe as actividades da via, limitando assim a função do CUEDC2.
Além disso, o papel do CUEDC2 é modulado pela via MAPK/ERK, que pode ser inibida por U0126 e PD98059. Estes inibidores têm como alvo a MEK1/2, reduzindo efetivamente a atividade da via ERK e, por conseguinte, o papel do CUEDC2 nesta via de sinalização. O SB203580 e o SP600125, por outro lado, têm como alvo a p38 MAP quinase e a c-Jun N-terminal quinase (JNK), respetivamente. A inibição da p38 MAP quinase pelo SB203580 reduz o envolvimento do CUEDC2 na resposta ao stress e na produção de citocinas, enquanto o SP600125 suprime a JNK para limitar o papel do CUEDC2 nas respostas inflamatórias. As cinases da família Src, que podem ser inibidas pela PP2, também afectam a funcionalidade do CUEDC2, impedindo a sua participação em eventos de sinalização relacionados com a Src. Por último, o CUEDC2 é regulado através da fosforilação pela proteína quinase C (PKC), e inibidores como o Go6983, Ro-31-8220 e GF109203X obstruem a atividade da PKC. Esta prevenção da fosforilação pelos inibidores da PKC impede diretamente a ativação do CUEDC2 e as suas subsequentes interacções de sinalização. O Y-27632, que inibe a proteína cinase associada à Rho (ROCK), também afecta o CUEDC2 ao interromper os processos regulados pela via Rho/ROCK, que podem ser cruciais para as funções reguladoras do CUEDC2.
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