Os activadores da Cdc42EP3 são um grupo diversificado de compostos que influenciam a função da proteína através de vários mecanismos, principalmente relacionados com a modulação dos níveis intracelulares de AMPc, a sinalização da GTPase Rho e a atividade da quinase. A Cdc42EP3 é uma proteína de suporte que interage com efetores da família Rho de GTPases, como a Rac1, para modular a sua atividade. Vários destes compostos, como o EGF, o LY294002 e a esfingosina-1-fosfato, medeiam os seus efeitos através destas GTPases, levando à ativação da Cdc42EP3 e ao reforço das suas funções de suporte.
Outros activadores de Cdc42EP3 funcionam através de sinalização dependente de cAMP e ativação de cinase. Por exemplo, a epinefrina, a forskolina, o IBMX, a cafeína, a prostaglandina E2 e o PACAP aumentam os níveis intracelulares de AMPc, que ativa a proteína quinase A (PKA). A PKA pode então fosforilar e ativar a Cdc42EP3, aumentando a sua capacidade de se tornar um andaime para as proteínas efectoras. Do mesmo modo, a bradicinina e a vasopressina funcionam através da via IP3/DAG, levando à ativação da proteína quinase C (PKC). A PKC activada pode também fosforilar e ativar a Cdc42EP3. O LPA, por outro lado, funciona através da via da Rho/Rho quinase, com a Rho quinase activada capaz de fosforilar e ativar a Cdc42EP3.
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