Os inibidores de CCDC63 abrangem uma gama diversificada de compostos que podem influenciar indiretamente a sua atividade funcional através dos seus efeitos em vários processos celulares e vias de sinalização. Por exemplo, sabe-se que a Brefeldina A e a Monensina perturbam a função e a manutenção do aparelho de Golgi, o que pode levar a uma localização incorrecta ou a uma modificação pós-traducional inadequada do CCDC63, prejudicando assim a sua função. Da mesma forma, os agentes que visam os microtúbulos, como o Paclitaxel e o Nocodazole, que são conhecidos por interroper a progressão do ciclo celular, poderiam inibir indiretamente a função da CCDC63 se esta dependesse de sinais do ciclo celular ou da dinâmica dos microtúbulos.
Além disso, as acções dos inibidores das CDK, como o Purvalanol A, que impedem a progressão do ciclo celular, podem levar indiretamente à inibição da CCDC63 se a sua atividade for regulada através de vias de sinalização dependentes do ciclo celular. Os inibidores das principais cinases mitóticas, como o MLN8237, o ZM447439 e o BI 2536, demonstram o potencial para inibir a CCDC63, perturbando processos como o alinhamento dos cromossomas, a montagem do fuso e a saída mitótica, que podem ser essenciais para a função adequada da CCDC63.
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