CCDC28B Ativadores

Os activadores comuns do CCDC28B incluem, entre outros, a forskolina CAS 66575-29-9, o IBMX CAS 28822-58-4, o rolipram CAS 61413-54-5, o ácido okadaico CAS 78111-17-8 e a calicilina A CAS 101932-71-2.

Os activadores CCDC28B referem-se a um grupo de compostos que aumentam a atividade da proteína codificada pelo gene CCDC28B. Partindo do princípio de que essa classe existe, o passo inicial para identificar esses activadores envolveria a utilização de técnicas de rastreio de elevado rendimento (HTS). Este processo analisa vastas bibliotecas de compostos químicos para descobrir moléculas que possam aumentar a atividade do CCDC28B. Estes rastreios utilizam normalmente ensaios baseados em células ou in vitro que podem detetar alterações na função da proteína, muitas vezes através de repórteres fluorescentes ou luminescentes que respondem aos níveis de atividade da proteína. Os compostos que produzem um aumento mensurável e reprodutível do sinal correspondente à atividade da proteína são seleccionados para estudo posterior. Em seguida, são efectuados ensaios secundários para confirmar a especificidade dos efeitos dos compostos na CCDC28B.

Após a identificação dos potenciais activadores, a fase seguinte consiste em compreender a interação entre estas moléculas e a proteína CCDC28B. Podem ser utilizadas técnicas de biologia estrutural, como a cristalografia de raios X ou a microscopia crioelectrónica, para visualizar a ligação dos activadores à proteína a um nível atómico. Esta informação é inestimável, uma vez que permite a identificação dos principais locais de ligação e as alterações conformacionais na proteína que resultam num aumento da atividade. Simultaneamente, são utilizados ensaios biofísicos, como a ressonância plasmónica de superfície (SPR) e a calorimetria de titulação isotérmica (ITC), para quantificar a cinética de ligação e a afinidade dos activadores à proteína. Estes estudos oferecem informações sobre a rapidez e a força com que os activadores se associam à proteína. Além disso, os estudos de relação estrutura-atividade (SAR) são implementados para otimizar a estrutura química do ativador para uma melhor eficácia e seletividade. Os químicos sintetizam análogos dos compostos activos, alterando metodicamente partes da molécula e medindo as alterações resultantes na atividade do CCDC28B.